La commune d'Iholdy se trouve dans le département des Pyrénées-Atlantiques, en région Nouvelle-Aquitaine.
Elle se situe à 104 km par la route de Pau, préfecture du département, à 43 km de Bayonne, sous-préfecture, et à 18 km de Saint-Palais, bureau centralisateur du canton du Pays de Bidache, Amikuze et Ostibarre dont dépend la commune depuis 2015 pour les élections départementales. La commune fait en outre partie du bassin de vie de Saint-Palais.
Les communes les plus proches sont :
- Armendarits (2,3 km)
- Irissarry (5,1km)
- Suhescun (5,4 km)
- Lantabat (5,8 km)
- Hélette (5,9 km)
- Méharin (6,4 km)
- Saint-Esteben (6,7 km)
- Saint-Martin-d'Arberoue (7,1 km).
Sur le plan historique et culturel, Iholdy fait partie de la province de la Basse-Navarre, un des sept territoires composant le Pays basque. La Basse-Navarre en est la province la plus variée en ce qui concerne son patrimoine, mais aussi la plus complexe du fait de son morcellement géographique. Depuis 1999, l'Académie de la langue basque ou Euskalzaindia divise la Basse-Navarre en six zones. La commune est dans le pays d’Arberoue (Arberoa), au nord-ouest de ce territoire.